首个涵盖物种及关系的“生命树”草图上线

9月 28, 2015
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涵盖动物、植物、真菌、微生物约230万个已命名物种的“生命树”草图。 费时3年, 集合了超过450个'小树'的草图。 图片源自:Stephen Smith涵盖动物、植物、真菌、微生物约230万个已命名物种的“生命树”草图。 费时3年, 集合了超过450个’小树’的草图。 图片源自:Stephen Smith密歇根大学、杜克大学等11家大学机构的研究人员联合发布了首个涵盖动物、植物、真菌、微生物约230万个已命名物种的”生命树”草图。 这份草图追溯到35亿年前地球的生命起源,描述了生物随时间进化分支形成不同物种的关系。

各类较小不同物种生命进化的分支近年均被发现与公布,但把所有这些结果结合起来,形成一个涵盖所有生物的”生命树”这还是第一次。最终成果是一个开放数据库,任何人都可以上网自由访问、使用或编辑,就像是个生命树版本的”维基百科”。

弄清物种间的亲缘关系,而且有助于科学家发现新药、提高作物和牲畜产量、追踪例如HIV、埃博拉和流感等传染病的起源和传播。

该项目负责人兼主要研究人员、杜克大学的研究员Karen Cranston说:”这是学界首次尝试将所有的点连接起来,可把它想成是版本1.0。”

密歇根大学演化生物学家Stephen Smith的团队负责连接所有分枝和树干。Smith说,将这484棵小树结合成大树是个艰苦的过程,共花了3年时间。和Smith同为第一作者的爱达荷大学研究人员Cody Hinchliff表示:”许多参与的研究人员贡献了数百小时从文献中追溯和整理数千个分支,挑出484个来产生生命之树的草稿。”

“这棵树不但显示了我们对物种关系的认识,也反映了我们仍有所不知。这棵树对其他研究人员来说是重要的起点,接下来几十年,研究人员可以将此作为修改、精进的依据。” 共同作者、佛罗里达大学研究员Douglas Soltis补充道。

为了继续填满这棵树,密歇根大学的研究团队正在开发一套软体,发展新的工具、技术及分析能力,以便日后物种的更新、添加及修改。

浏览及下载现今版本的”生命树”及背后的数据和源代码: https://tree.opentreeoflife.org.